141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2464 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
201 aa  397  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.97 
 
 
306 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.1 
 
 
306 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  41.56 
 
 
462 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.72 
 
 
322 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.39 
 
 
391 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.53 
 
 
323 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.69 
 
 
356 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 
319 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.52 
 
 
372 aa  91.3  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.24 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.71 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.69 
 
 
356 aa  82  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.94 
 
 
334 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.98 
 
 
629 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.84 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  40.87 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  53.97 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.39 
 
 
317 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  57.69 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.48 
 
 
1089 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.35 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.77 
 
 
128 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.25 
 
 
379 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  34.69 
 
 
383 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.14 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  37.61 
 
 
409 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.34 
 
 
383 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  36.44 
 
 
396 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.14 
 
 
332 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.88 
 
 
382 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.09 
 
 
266 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  33.12 
 
 
379 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.72 
 
 
575 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.86 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  46.97 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  31.25 
 
 
313 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.7 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.48 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.17 
 
 
412 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  31.76 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 
554 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.04 
 
 
635 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  34.46 
 
 
375 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  52 
 
 
974 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  32.77 
 
 
395 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.54 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.79 
 
 
288 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  47.89 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 
313 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  37.27 
 
 
438 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.23 
 
 
143 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.14 
 
 
364 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  47.37 
 
 
276 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.31 
 
 
225 aa  51.2  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4180  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  50.94 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4246  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.94 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537178  normal  0.324419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4402  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.94 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  33.04 
 
 
406 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 
294 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  45.83 
 
 
2277 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  24.71 
 
 
317 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  28 
 
 
324 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  46.43 
 
 
349 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 
554 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.93 
 
 
395 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.36 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.12 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.83 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  61.11 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
398 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
398 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
398 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.6 
 
 
260 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  34.51 
 
 
358 aa  48.5  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  45.28 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.13 
 
 
234 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  45.61 
 
 
266 aa  48.5  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.56 
 
 
321 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 
395 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.29 
 
 
792 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.5 
 
 
77 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4330  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.23 
 
 
485 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  46.55 
 
 
423 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
246 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1872  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.322765  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0048  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlA  30.48 
 
 
364 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0248425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  39.06 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2880  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.51 
 
 
137 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248233  normal  0.229872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>