42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2841 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
554 aa  1130    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.44 
 
 
224 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.12 
 
 
266 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.76 
 
 
391 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.67 
 
 
372 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  37.84 
 
 
280 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.51 
 
 
974 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
246 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.82 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  35.96 
 
 
438 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 
201 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
464 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 
1089 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  29.45 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.72 
 
 
487 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.82 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.43 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  28.77 
 
 
395 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.54 
 
 
323 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  26.04 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.28 
 
 
554 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 
306 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.75 
 
 
263 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 
667 aa  47.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
378 aa  47  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
160 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  35.23 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  41.56 
 
 
204 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.47 
 
 
322 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 
160 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  39.68 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  31.17 
 
 
358 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  29.17 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.5 
 
 
379 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.19 
 
 
182 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.05 
 
 
329 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  39.39 
 
 
285 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.76 
 
 
266 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.26 
 
 
300 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.31 
 
 
128 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.62 
 
 
306 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>