66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3185 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.56 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.64 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.27 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.23 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.43 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.96 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  33.06 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  43.55 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.77 
 
 		 364 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.14 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  33.72 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 313 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  30.37 
 
 		 462 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3890  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3695  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.39 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.93 
 
 		 323 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  29.17 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.19 
 
 		 382 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.54 
 
 		 323 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  29.05 
 
 		 379 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  38.67 
 
 		 2277 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 288 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  55.26 
 
 		 297 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  28.03 
 
 		 395 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 128 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  50 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 		 447 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  28.18 
 
 		 396 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.83 
 
 		 280 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3696  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.33 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.04 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  29.2 
 
 		 241 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  27.68 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.61 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.96 
 
 		 334 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 554 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.07 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  30.61 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  41.94 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.77 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  42.86 
 
 		 349 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.81 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 		 358 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  27.19 
 
 		 378 aa  42.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.38 
 
 		 433 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 321 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 317 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 		 224 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 792 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 143 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.55 
 
 		 422 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  24.73 
 
 		 313 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38.98 
 
 		 423 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 279 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 412 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>