278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  100 
 
 		 422 aa  841    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  26.41 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  25.54 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  34.53 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  32.1 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.07 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  38.02 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.36 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  26.26 
 
 		 232 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.13 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  33.07 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  24.44 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  36 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.59 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  37.4 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  35.58 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  37.4 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.42 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  35.2 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.68 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0613  NLP/P60 protein  37.37 
 
 		 502 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.322284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.06 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  34.58 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  36.61 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 239 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 190 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  34.4 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  29.66 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  35.2 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.19 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  35.25 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  44.58 
 
 		 228 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  35.97 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.21 
 
 		 222 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  33.01 
 
 		 231 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.64 
 
 		 475 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 199 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  35 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  34.82 
 
 		 188 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  35.29 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.09 
 
 		 242 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  44.12 
 
 		 239 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  33.01 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  30.4 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 273 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  33.81 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06710  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.84 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  33.93 
 
 		 236 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  29.82 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  34.71 
 
 		 241 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 		 317 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.71 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  34.71 
 
 		 241 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  35.45 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  24.74 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  32.03 
 
 		 181 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5119  NLP/P60 protein  32.04 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.553866  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.33 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  37.38 
 
 		 308 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 324 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  31.13 
 
 		 188 aa  50.4  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  35.35 
 
 		 275 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  32.31 
 
 		 501 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  30.82 
 
 		 228 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  35.35 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  35.24 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  44.78 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  27.87 
 
 		 536 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.22 
 
 		 224 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  31.03 
 
 		 208 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>