128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  54.82 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  52.32 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.29 
 
 		 433 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.02 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  44.87 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  31.2 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  34.69 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  37.25 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.21 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  43.24 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  44.83 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  37.5 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  30.28 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 143 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.64 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  38.81 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  29.59 
 
 		 396 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.87 
 
 		 160 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  36.27 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  36.27 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 412 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  41.18 
 
 		 358 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  43.08 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.54 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2841  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.62 
 
 		 554 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00157478  normal  0.0185409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.3 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.02 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  42.86 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  33.59 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 360 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  36.36 
 
 		 383 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 1089 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  36.27 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  39.13 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0755  hypothetical protein  37.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.611923  normal  0.449377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  30.28 
 
 		 143 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  46.88 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  41.79 
 
 		 383 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  43.08 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2908  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0270551  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.33 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.25 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  37.93 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.93 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 974 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  31.07 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3185  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.3 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00515387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  40.98 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  31 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  45.45 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  31.11 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 77 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  34.15 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  34.78 
 
 		 146 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  38.46 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  36 
 
 		 762 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.58 
 
 		 323 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.86 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.26 
 
 		 447 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 		 309 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.92 
 
 		 352 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 575 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  32.93 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.08 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1581  Peptidase M15A  38.1 
 
 		 102 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 629 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  30.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.34 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  40 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  30.84 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.23 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  38.1 
 
 		 409 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.89 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>