67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0939 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3574  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2852  hypothetical protein  48.68 
 
 		 335 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.64 
 
 		 954 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.88 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  50 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  46.43 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.65 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  38.54 
 
 		 379 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  42.62 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  50 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  37.5 
 
 		 2277 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.1 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2053  Chitosanase  29.44 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  29.41 
 
 		 414 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.79 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  40.32 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.15 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.88 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.22 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 198 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  45.28 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  37.66 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.86 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  43.33 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 1089 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  38.89 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  40.98 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.94 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  46.43 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  42.31 
 
 		 349 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  29.73 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  37.18 
 
 		 536 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  43.86 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.21 
 
 		 531 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  35.16 
 
 		 383 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  42.86 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.36 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.82 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.86 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.68 
 
 		 163 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.68 
 
 		 356 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  42.59 
 
 		 406 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>