129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1443 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  59.73 
 
 
263 aa  275  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  52.32 
 
 
246 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.66 
 
 
433 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  37.86 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  43.18 
 
 
462 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.57 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.79 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  41.3 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.46 
 
 
319 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.71 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  40.7 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  46.88 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.28 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.7 
 
 
762 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 
321 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  45.16 
 
 
409 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  38.55 
 
 
143 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.59 
 
 
1089 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  41.27 
 
 
406 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.26 
 
 
170 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  36.46 
 
 
454 aa  52  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  43.75 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.83 
 
 
77 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  50 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  44.87 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 
395 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  40.79 
 
 
352 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 
391 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  37.33 
 
 
349 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 
395 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.38 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.36 
 
 
160 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
383 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  45.16 
 
 
438 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.55 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  38.55 
 
 
143 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  40.68 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.23 
 
 
360 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.51 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.62 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  37.8 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.47 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  48.33 
 
 
224 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  36.76 
 
 
396 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  34.65 
 
 
383 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.97 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.08 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.02 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.8 
 
 
635 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.28 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.12 
 
 
575 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.78 
 
 
128 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.5 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.83 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 
398 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  32.29 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 
313 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  39.08 
 
 
124 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  40.85 
 
 
379 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.73 
 
 
382 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.06 
 
 
332 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  46.15 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.24 
 
 
549 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
487 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  36.23 
 
 
570 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  38.57 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.54 
 
 
163 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  33.73 
 
 
146 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.18 
 
 
323 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  41.18 
 
 
358 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.82 
 
 
447 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  36.76 
 
 
313 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  36.76 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  38.55 
 
 
143 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.79 
 
 
294 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3152  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0939  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 
310 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  39.76 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  42.42 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04480  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.09 
 
 
422 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38395  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  39.06 
 
 
378 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.85 
 
 
364 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0153  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.31 
 
 
665 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.54 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.14 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  39.68 
 
 
450 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.93 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.68 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  31 
 
 
629 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 
667 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21900  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.94 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>