More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0837 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
395 aa  798    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  88.58 
 
 
398 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  88.58 
 
 
398 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  88.58 
 
 
398 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  93.15 
 
 
395 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  84.95 
 
 
406 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  65.32 
 
 
395 aa  511  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  64.23 
 
 
396 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  54.12 
 
 
379 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.56 
 
 
382 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  48.84 
 
 
383 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  48.45 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  49.22 
 
 
387 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  45.87 
 
 
409 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  47.49 
 
 
383 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  44.72 
 
 
378 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  40.85 
 
 
438 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  43.64 
 
 
381 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  37.74 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.66 
 
 
657 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 
323 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.86 
 
 
242 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  25.42 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  28.49 
 
 
703 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.81 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.46 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.21 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.5 
 
 
257 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  27.93 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.11 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.51 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.42 
 
 
476 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  27.96 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 
623 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.78 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.69 
 
 
860 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  28.33 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1752  cell wall hydrolase/autolysin  27.19 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000020425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  25.13 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  26.98 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1037  cell wall hydrolase/autolysin  27.75 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  29.57 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  26.11 
 
 
948 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1350  cell wall hydrolase/autolysin  26.11 
 
 
529 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000116689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  26.6 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0112348  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.23 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0071  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000157753  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.55 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2496  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.51 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 
619 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  60.71 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2385  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.39 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.282435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2941  cell wall hydrolase/autolysin  25.97 
 
 
250 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000101461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.72 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  30.61 
 
 
538 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.5 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2589  cell wall hydrolase/autolysin  28.26 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.91 
 
 
601 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419144  normal  0.116677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.54 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.72 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000016019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  23.66 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  27.14 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2161  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.68 
 
 
603 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.72441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  40.37 
 
 
241 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2251  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.68 
 
 
603 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0506573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
476 aa  67  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.27 
 
 
657 aa  66.6  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0142  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.04 
 
 
603 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.454848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.04 
 
 
619 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  36.96 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0254  cell wall hydrolase/autolysin  27.78 
 
 
604 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18931  cell wall hydrolase/autolysin  28.04 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.306827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  27.66 
 
 
612 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.66 
 
 
612 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1694  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.51 
 
 
608 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.739566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.21 
 
 
762 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0045  surface-layer n-acetylmuramoyl-l-alanine amidase  28.85 
 
 
531 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000055922  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5325  cell wall hydrolase/autolysin  26.37 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0180  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.94 
 
 
228 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  25.81 
 
 
627 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  53.57 
 
 
270 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1654  cell wall hydrolase/autolysin  29.35 
 
 
239 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.53 
 
 
334 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.24 
 
 
540 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 
160 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.05 
 
 
575 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  26.6 
 
 
876 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.97 
 
 
815 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.67 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1153  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.31 
 
 
731 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.41 
 
 
549 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  29.19 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  27.32 
 
 
527 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  26.74 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  24.66 
 
 
240 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0645  cell wall hydrolase/autolysin  27.46 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>