More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0864 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 		 476 aa  972    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  47.77 
 
 		 293 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  46.41 
 
 		 256 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  48.89 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  48.89 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  47.68 
 
 		 256 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  47.68 
 
 		 259 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  47.6 
 
 		 256 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  44.59 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.69 
 
 		 257 aa  156  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.09 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.79 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.37 
 
 		 316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0071  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.72 
 
 		 238 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000157753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.64 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.2 
 
 		 314 aa  143  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.1 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  37.86 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  40.27 
 
 		 290 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2295  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  37.33 
 
 		 259 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000158579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  41.74 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0265  cell wall hydrolase/autolysin  36.16 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.5 
 
 		 264 aa  136  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.36 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.44 
 
 		 253 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0332  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.3 
 
 		 263 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000783569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.5 
 
 		 249 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  36.28 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  36.21 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.05 
 
 		 334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.21 
 
 		 319 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  36.91 
 
 		 320 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.44 
 
 		 313 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  37.05 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.05 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  37.07 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0322  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase CwlD  37.07 
 
 		 246 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0112348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  36.21 
 
 		 319 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.71 
 
 		 336 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 336 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.44 
 
 		 245 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.32 
 
 		 251 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  32.91 
 
 		 260 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  38.87 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.33 
 
 		 318 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.96 
 
 		 319 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  33.19 
 
 		 270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.29 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  35.93 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2397  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.11 
 
 		 283 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  35.84 
 
 		 219 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.71 
 
 		 272 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.84 
 
 		 259 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.27 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.64 
 
 		 543 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.57 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.56 
 
 		 309 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.84 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.18 
 
 		 251 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.82 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  37.56 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.33 
 
 		 250 aa  121  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.12 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  35.87 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  32.84 
 
 		 240 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.56 
 
 		 247 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.96 
 
 		 233 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  32.47 
 
 		 240 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.5 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.28 
 
 		 251 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.12 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.28 
 
 		 251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  36.84 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  33.48 
 
 		 258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.84 
 
 		 543 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.1 
 
 		 657 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.84 
 
 		 251 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.8 
 
 		 251 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.45 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.28 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  34.98 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.5 
 
 		 860 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.44 
 
 		 238 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.51 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>