130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1893 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  850    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.79 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.72 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.73 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.27 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  40.55 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.91 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.09 
 
 		 461 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3017  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.79 
 
 		 399 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3450  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.56 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.79 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.33 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  35.46 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.57 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  32.75 
 
 		 395 aa  136  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  36.86 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.13 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.65 
 
 		 320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.4 
 
 		 259 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.61 
 
 		 256 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.56 
 
 		 392 aa  130  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.87 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  36.94 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.94 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.98 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 		 259 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.39 
 
 		 334 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  36.56 
 
 		 256 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  36.56 
 
 		 256 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.24 
 
 		 259 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.33 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.72 
 
 		 264 aa  123  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  37.79 
 
 		 258 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  35.91 
 
 		 259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.16 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3886  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.8 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0615544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  37.79 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1063  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.56 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.450222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.6 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  34.09 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1471  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.64 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  35.14 
 
 		 258 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  36.57 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.57 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4210  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.33 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.99 
 
 		 247 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.32 
 
 		 245 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.78 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  32.59 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.48 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.19 
 
 		 313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  36.53 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.33 
 
 		 255 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.81 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  34.72 
 
 		 315 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.44 
 
 		 293 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.22 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  34.07 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.99 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0565  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.63 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  36.31 
 
 		 253 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.5 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.5 
 
 		 251 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.03 
 
 		 250 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.95 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.65 
 
 		 279 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.48 
 
 		 342 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  33.86 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0413  hypothetical protein  34.08 
 
 		 407 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0526  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.64 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0165  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.46 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.06 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0450  hypothetical protein  31.75 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.182415  normal  0.743995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0259  hypothetical protein  32.29 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.881975 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1659  hypothetical protein  29.58 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.88 
 
 		 251 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  34.63 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.93 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.79 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.88 
 
 		 251 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>