130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0040 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  98.41 
 
 		 251 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  98.01 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  90.84 
 
 		 251 aa  472  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  80.08 
 
 		 251 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  80.08 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  80.08 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  80.08 
 
 		 251 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  74.69 
 
 		 247 aa  371  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  64.94 
 
 		 253 aa  341  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  67.49 
 
 		 251 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  69.37 
 
 		 245 aa  324  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  68.3 
 
 		 251 aa  321  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  61.79 
 
 		 250 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  66.09 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  62.5 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  44.35 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  43.75 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  47.69 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  41.67 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.04 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  41.4 
 
 		 392 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  41.36 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 320 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  40.27 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  40.27 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.27 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.78 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.84 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  37.75 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.75 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.68 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  39.82 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.09 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.25 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.09 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  38.14 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  38.76 
 
 		 382 aa  156  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  38.79 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  37.96 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  37.85 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  36.99 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.38 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  38.33 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  38.33 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  41.44 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  40.72 
 
 		 482 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  36.53 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.04 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  35.98 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.51 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.68 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.57 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  34.1 
 
 		 430 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.62 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.65 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  34.4 
 
 		 395 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.52 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.19 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  34.23 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  34.11 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.68 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.49 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.3 
 
 		 256 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  33.18 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  32.17 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.55 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.28 
 
 		 476 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  35.5 
 
 		 432 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.53 
 
 		 403 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.09 
 
 		 433 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.33 
 
 		 543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.64 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  32.41 
 
 		 488 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  31.75 
 
 		 390 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.78 
 
 		 461 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.96 
 
 		 490 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0793  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.56 
 
 		 391 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  31.68 
 
 		 387 aa  90.1  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2004  ferric-uptake regulator  30.37 
 
 		 483 aa  90.1  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0798  divergent polysaccharide deacetylase superfamily protein  28.85 
 
 		 293 aa  88.6  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2471  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.57 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111535  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.92 
 
 		 325 aa  85.1  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0661  hypothetical protein  29.49 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.566707  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.395086  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.37 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>