112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0870 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 		 381 aa  786    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  35.13 
 
 		 387 aa  222  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1659  hypothetical protein  37.75 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0947  conserved hypothetical protein, polysaccharide deacetylase domain protein  35.91 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1580  polysaccharide deacetylase family protein  46.7 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0661  hypothetical protein  45.35 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.566707  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0736  hypothetical protein  41.94 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.395086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2004  ferric-uptake regulator  43.98 
 
 		 483 aa  197  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0375  polysaccharide deacetylase family protein  35.05 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1366  putative periplasmic protein  50.31 
 
 		 207 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.668275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  35.78 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.18 
 
 		 336 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.85 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.82 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.89 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.84 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.04 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.28 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  32.31 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.31 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  33.6 
 
 		 290 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.71 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.31 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  104  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  32.87 
 
 		 258 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  32.31 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  32.87 
 
 		 257 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.69 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.23 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  29.11 
 
 		 259 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.02 
 
 		 315 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  32.41 
 
 		 395 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.58 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.58 
 
 		 482 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  32.24 
 
 		 260 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.55 
 
 		 245 aa  94  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.64 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.42 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.03 
 
 		 490 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.24 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.52 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00545  hypothetical protein  35 
 
 		 253 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.671314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.8 
 
 		 259 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.8 
 
 		 259 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  31 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  31.28 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.22 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.53 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.12 
 
 		 272 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.23 
 
 		 251 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  30 
 
 		 255 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.28 
 
 		 264 aa  86.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.48 
 
 		 253 aa  85.9  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.04 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  29.74 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.63 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  26.48 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  31.07 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0798  divergent polysaccharide deacetylase superfamily protein  30.54 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  29.29 
 
 		 432 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.17 
 
 		 251 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.73 
 
 		 279 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  29.63 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.63 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.37 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.76 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.37 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.44 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  27.88 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  26.76 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  26.76 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0793  protein of unknown function DUF610 YibQ  25.96 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  28.29 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.18 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.84 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  30.27 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.13 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.93 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  28.44 
 
 		 256 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  28.44 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.44 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2471  protein of unknown function DUF610 YibQ  28.57 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  28 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  28 
 
 		 256 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>