129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0895 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0895  protein of unknown function DUF610 YibQ  100 
 
 
490 aa  974    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0461131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3159  protein of unknown function DUF610 YibQ  45.62 
 
 
543 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0142078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0924  protein of unknown function DUF610, YibQ  42.37 
 
 
461 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1438  hypothetical protein  47.57 
 
 
488 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0614604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2867  protein of unknown function DUF610 YibQ  40.32 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00589273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2160  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.17 
 
 
403 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.820205  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3062  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.82 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1672  hypothetical protein  38.67 
 
 
395 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0953681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0726  protein of unknown function DUF610 YibQ  36.91 
 
 
392 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3508  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.93 
 
 
482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1402  protein of unknown function DUF610, YibQ  39.24 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.336614  hitchhiker  0.000448434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2567  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.36 
 
 
264 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245403  hitchhiker  0.00802538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2454  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.33 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000302345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1919  protein of unknown function DUF610 YibQ  38.39 
 
 
334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1850  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.89 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000290484  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0491  hypothetical protein  37.62 
 
 
382 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1769  hypothetical protein  37.9 
 
 
290 aa  123  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0298619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4888  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1253  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.3 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1442  hypothetical protein  35.68 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1888  protein of unknown function DUF610, YibQ  36.32 
 
 
313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.811898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5110  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 
259 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1126  putative periplasmic protein  29.2 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3030  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.09 
 
 
316 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3289  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.83 
 
 
279 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1577  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.61 
 
 
271 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0623724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1209  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.12 
 
 
272 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0491  protein of unknown function DUF610 YibQ  39.06 
 
 
325 aa  117  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5330  hypothetical protein  36.53 
 
 
260 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0037  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.88 
 
 
247 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2408  protein of unknown function DUF610, YibQ  37.9 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000297515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4085  hypothetical protein  34.67 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0406  protein of unknown function DUF610 YibQ  37.44 
 
 
259 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.46243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4366  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.67 
 
 
313 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1893  hypothetical protein  35.22 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5870  hypothetical protein  36.65 
 
 
258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0375  polysaccharide deacetylase family protein  33.83 
 
 
354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4393  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67820  hypothetical protein  36.12 
 
 
257 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5059  hypothetical protein  35.56 
 
 
255 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4932  protein of unknown function DUF610, YibQ  35.56 
 
 
255 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0046  hypothetical protein  33.79 
 
 
251 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0330  hypothetical protein  35.84 
 
 
258 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4821  protein of unknown function DUF610 YibQ  35.18 
 
 
318 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.674115  hitchhiker  0.000223669 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3986  divergent polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4031  divergent polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00871141  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3905  divergent polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  0.446068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3924  divergent polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4092  divergent polysaccharide deacetylase  34.17 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2503  hypothetical protein  34.13 
 
 
390 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181998  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0121  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.67 
 
 
314 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1161  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.7 
 
 
293 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.380632  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0073  divergent polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 
336 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4143  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.66 
 
 
336 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3952  polysaccharide deacetylase family protein  29.66 
 
 
319 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4023  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.51 
 
 
238 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.958404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0176  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.67 
 
 
319 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.686175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4043  polysaccharide deacetylase family protein  29.66 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.451562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03472  predicted polysaccharide deacetylase  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3943  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.67 
 
 
309 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03423  hypothetical protein  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.511041  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3826  polysaccharide deacetylase family protein  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.686921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4119  polysaccharide deacetylase family protein  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0094  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4987  polysaccharide deacetylase family protein  32.16 
 
 
319 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0091  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.16 
 
 
319 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0040  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.33 
 
 
251 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00288732 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.12 
 
 
476 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4220  protein of unknown function DUF610 YibQ  34.34 
 
 
251 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3701  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.5 
 
 
245 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0048  protein of unknown function DUF610, YibQ  33.33 
 
 
251 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102958 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0870  protein of unknown function DUF610 YibQ  33.03 
 
 
381 aa  103  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0042  protein of unknown function DUF610, YibQ  32.88 
 
 
251 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185934  hitchhiker  0.000313161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  32.42 
 
 
251 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000152753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0057  protein of unknown function DUF610, YibQ  30 
 
 
250 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.313836  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3809  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.51 
 
 
251 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.69946  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3959  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1447  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1250  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1225  divergent polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
256 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1385  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1349  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1422  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1057  protein of unknown function DUF610 YibQ  30.58 
 
 
256 aa  99.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4473  protein of unknown function DUF610, YibQ  31.66 
 
 
253 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00361162  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1248  protein of unknown function DUF610 YibQ  29.63 
 
 
256 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1488  hypothetical protein  30.16 
 
 
256 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1223  divergent polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
259 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00241511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4335  hypothetical protein  31.51 
 
 
251 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2004  ferric-uptake regulator  29.86 
 
 
483 aa  98.2  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0040  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.96 
 
 
251 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3169  protein of unknown function DUF610, YibQ  32 
 
 
272 aa  97.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0798  divergent polysaccharide deacetylase superfamily protein  27.94 
 
 
293 aa  97.1  7e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0044  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.96 
 
 
251 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244614  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2471  protein of unknown function DUF610 YibQ  27.67 
 
 
302 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3609  protein of unknown function DUF610, YibQ  29.95 
 
 
255 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4880  protein of unknown function DUF610 YibQ  31.16 
 
 
251 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0661  hypothetical protein  30.49 
 
 
360 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.566707  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1580  polysaccharide deacetylase family protein  29.28 
 
 
464 aa  95.1  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0736  hypothetical protein  29.6 
 
 
360 aa  90.9  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.395086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>