201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0032 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 323 aa  639    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  33.97 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.47 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  32.76 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  33.23 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.45 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  32 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03950  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  40.54 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.759104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.75 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  30.23 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 395 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  28.69 
 
 		 379 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  30.47 
 
 		 396 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  31.89 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.28 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  29.79 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  42.47 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  41.1 
 
 		 392 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.71 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  29.97 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.37 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.03 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19610  negative regulator of beta-lactamase expression  45.33 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.46 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.47 
 
 		 77 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.82 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  46.48 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  28.67 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.12 
 
 		 433 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.47 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  31.33 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.46 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  34.88 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  33.13 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  46.67 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 523 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  34.48 
 
 		 2277 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  34.55 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 635 aa  55.8  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  45.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.16 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  41.75 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  51.92 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.54 
 
 		 478 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.88 
 
 		 160 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.19 
 
 		 225 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 447 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 322 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  28.79 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 434 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 379 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.27 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.18 
 
 		 762 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 575 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  35.48 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  49.02 
 
 		 430 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.58 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.08 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.98 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 405 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 438 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 116 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  36.51 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  54.35 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  42.62 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.03 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.36 
 
 		 629 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  45 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  48 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.68 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>