151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2632 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  44.83 
 
 		 448 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  51.85 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  44.83 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 1072 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  42.17 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  44.79 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.32 
 
 		 1261 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 1557 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.58 
 
 		 424 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  54.72 
 
 		 425 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  49.09 
 
 		 389 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  38.3 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 266 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 438 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 395 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  45.9 
 
 		 427 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 		 418 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.06 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  35.9 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  37.21 
 
 		 409 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 		 434 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  41.57 
 
 		 474 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 457 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  41.57 
 
 		 466 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  39.44 
 
 		 412 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 528 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.48 
 
 		 259 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  38 
 
 		 438 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.08 
 
 		 346 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 312 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  37.5 
 
 		 457 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 412 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 392 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  41.27 
 
 		 913 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  41.79 
 
 		 445 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 413 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  41.27 
 
 		 978 aa  47.4  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.3 
 
 		 462 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  27.37 
 
 		 232 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  40.98 
 
 		 440 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  47.73 
 
 		 400 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.54 
 
 		 573 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.41 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  40.3 
 
 		 438 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  31.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  31.48 
 
 		 253 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  43.64 
 
 		 458 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  45.28 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  44.44 
 
 		 411 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 438 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 1196 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.48 
 
 		 259 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.51 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  46.51 
 
 		 429 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  46.3 
 
 		 430 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  37.5 
 
 		 445 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  43.1 
 
 		 451 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  43.86 
 
 		 440 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  46.43 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  40 
 
 		 456 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 1226 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 328 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  40.79 
 
 		 398 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 		 417 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  39.51 
 
 		 410 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  44.9 
 
 		 398 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.9 
 
 		 391 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  44.9 
 
 		 398 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  43.33 
 
 		 398 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 396 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  44.9 
 
 		 398 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.09 
 
 		 1012 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 		 470 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  46 
 
 		 456 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  36 
 
 		 445 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 461 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.34 
 
 		 864 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1716  hypothetical protein  44.9 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1617  hypothetical protein  44.9 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  37.8 
 
 		 464 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  40.74 
 
 		 456 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0039  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 396 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  40.74 
 
 		 456 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  44.07 
 
 		 419 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  42.62 
 
 		 404 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  31.18 
 
 		 458 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  39.68 
 
 		 374 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  42.37 
 
 		 338 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  37.97 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>