49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0885 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 307 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  90.57 
 
 		 317 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.54 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  38.14 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  30.37 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  30.37 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  34 
 
 		 409 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  43.14 
 
 		 427 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 1012 aa  46.6  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.93 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 1261 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 266 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 116 aa  45.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  37.68 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  37.68 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37.68 
 
 		 430 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  38.98 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  37.7 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0672  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.29 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.317968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.56 
 
 		 250 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  29.51 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  37.29 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  39.13 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  36.23 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 409 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 451 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.62 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 487 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 470 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  41.18 
 
 		 458 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  38.33 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 201 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  43.9 
 
 		 438 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  30.91 
 
 		 438 aa  42.7  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 508 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 1557 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  40.74 
 
 		 413 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.78 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  30.34 
 
 		 424 aa  42.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 410 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>