72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4316 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  100 
 
 		 445 aa  926    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  73.2 
 
 		 440 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  55.53 
 
 		 445 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  52.8 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  52.35 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  52.57 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  52.01 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  52.43 
 
 		 457 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  52.86 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.05 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.69 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.07 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.15 
 
 		 435 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.64 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.52 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.91 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.02 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.77 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.34 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.05 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  22.96 
 
 		 377 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.86 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  27.49 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.28 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  31.15 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  23.88 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.13 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  27.85 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  24.4 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  24.44 
 
 		 308 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  28.12 
 
 		 337 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  23.38 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  21.77 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  29.13 
 
 		 337 aa  50.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  23.37 
 
 		 310 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.85 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  32.38 
 
 		 383 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  26 
 
 		 313 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 77 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  24.14 
 
 		 341 aa  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  25.52 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  23.39 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  23.9 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  21.24 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 239 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.82 
 
 		 762 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  23.12 
 
 		 305 aa  47  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 1557 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  22.93 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  42.59 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.76 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  48 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  23.16 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  22.86 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  48.89 
 
 		 239 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  53.33 
 
 		 480 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  20.74 
 
 		 304 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.31 
 
 		 318 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  36 
 
 		 116 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  23.18 
 
 		 303 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  35.21 
 
 		 352 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.04 
 
 		 302 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  42.19 
 
 		 270 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 508 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  44.9 
 
 		 228 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  45.1 
 
 		 267 aa  43.5  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  35.05 
 
 		 740 aa  43.5  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  48.89 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 		 229 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  21.53 
 
 		 303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  21.53 
 
 		 303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  21.53 
 
 		 303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>