59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1261 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  100 
 
 
311 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  56.48 
 
 
306 aa  338  7e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  52.58 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  50.82 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  56.07 
 
 
305 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  50.67 
 
 
379 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  49.19 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  48.68 
 
 
338 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  40.76 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  51.99 
 
 
313 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  52.98 
 
 
313 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  47.15 
 
 
430 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  46.41 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  44.97 
 
 
302 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  45.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  45.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  45.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  45.15 
 
 
305 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  43.29 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  47.02 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  42.81 
 
 
303 aa  228  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  43.09 
 
 
571 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  42.76 
 
 
308 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  41.84 
 
 
319 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  41.08 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  43.48 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  41.53 
 
 
376 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  42.62 
 
 
314 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  41.3 
 
 
308 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  42.47 
 
 
302 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  40.83 
 
 
303 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  37.71 
 
 
303 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  35.29 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  36.57 
 
 
340 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  35.53 
 
 
370 aa  158  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  35.02 
 
 
337 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  34.34 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  35.12 
 
 
373 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.06 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.15 
 
 
356 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.08 
 
 
373 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  24.31 
 
 
445 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.64 
 
 
428 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  27.68 
 
 
458 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.26 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.43 
 
 
428 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  26.17 
 
 
456 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25.35 
 
 
435 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  28.99 
 
 
457 aa  52.8  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.63 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  21.77 
 
 
445 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  23.87 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  23.87 
 
 
456 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  22.08 
 
 
440 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.57 
 
 
378 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25 
 
 
435 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  23.47 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  26.73 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>