45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2537 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  100 
 
 		 303 aa  603  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  52.56 
 
 		 319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  51.83 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  50 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.49 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  48.99 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  48.46 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  50.51 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  45.07 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  44.88 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  48.31 
 
 		 430 aa  232  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  42.05 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  45.58 
 
 		 406 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  42.86 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  40.34 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  44.26 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  41.69 
 
 		 313 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  42.37 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  40.52 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  39.73 
 
 		 338 aa  198  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  41.33 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  41.33 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  41.33 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  37.71 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  44.44 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  43.39 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  42.71 
 
 		 337 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  40.68 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  41.95 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  42.28 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  36.86 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  39 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  33.94 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  36.69 
 
 		 571 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  38.69 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  38.61 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  39.04 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  38.49 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.8 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.53 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  29.3 
 
 		 370 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.81 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  34.23 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.82 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.05 
 
 		 428 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>