62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1851 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  100 
 
 
373 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  65.68 
 
 
377 aa  475  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.51 
 
 
356 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  34.32 
 
 
378 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  27.47 
 
 
370 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  28.28 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  27.32 
 
 
440 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  30.65 
 
 
458 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  28.19 
 
 
456 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  29.9 
 
 
457 aa  90.5  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  29.25 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.84 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.77 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  26.15 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  26.15 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  29.82 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.08 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  30.15 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  31.48 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.08 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.41 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.88 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.21 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  28.28 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.93 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  31.28 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.22 
 
 
433 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.5 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  28.53 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  32.32 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.48 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25.91 
 
 
433 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  27.33 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  34.73 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  29.67 
 
 
304 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  28.26 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25.7 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  28.26 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  26.57 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  34.13 
 
 
337 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.27 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.8 
 
 
319 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  23.62 
 
 
306 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  27.3 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  30.36 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  27.17 
 
 
310 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  31.62 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  29.96 
 
 
314 aa  55.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  31.62 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  31.62 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  25.77 
 
 
571 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  30.99 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  29.06 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  31.4 
 
 
318 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  27.13 
 
 
303 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  28.66 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  40 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  38.82 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  37.65 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.27 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3907  hypothetical protein  24.6 
 
 
327 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  0.332979 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  29.57 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>