48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1242 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  100 
 
 
341 aa  685    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  58.88 
 
 
313 aa  382  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  44.18 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  40.76 
 
 
311 aa  265  8e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  41.96 
 
 
310 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  42.86 
 
 
379 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  42.39 
 
 
305 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  39.7 
 
 
313 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  42.25 
 
 
338 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  41.19 
 
 
406 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  41.49 
 
 
313 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  40.76 
 
 
430 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  39.53 
 
 
571 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  36.83 
 
 
304 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  38.74 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  40 
 
 
313 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  39.09 
 
 
319 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  36.83 
 
 
305 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  38.78 
 
 
303 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  39.1 
 
 
302 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  38.39 
 
 
303 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  38.39 
 
 
303 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  38.39 
 
 
303 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  34.13 
 
 
338 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  37.01 
 
 
313 aa  197  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  37.46 
 
 
308 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  37.61 
 
 
303 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  35.03 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  34.43 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  34.94 
 
 
308 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  36.04 
 
 
302 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  34.55 
 
 
303 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  36.89 
 
 
340 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  35.71 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  29.29 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  28.83 
 
 
337 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.72 
 
 
318 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  34.48 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  26.18 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  22.7 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  23.89 
 
 
458 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.48 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  25.17 
 
 
440 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  24.44 
 
 
457 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.84 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  32.69 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.85 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  22.75 
 
 
456 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>