52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2072 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  100 
 
 		 340 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  75.55 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  58.91 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  57.66 
 
 		 337 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  56.4 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.51 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  48.8 
 
 		 319 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  50 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  45.83 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  46.96 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  46.6 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  45.8 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  42.38 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  44.59 
 
 		 406 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  45.55 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  41.39 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  43.09 
 
 		 430 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  43.1 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  42.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  41.16 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  43 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  41.95 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  41.12 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  41.12 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  41.12 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  41.45 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  41.8 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  42.76 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  40.84 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  39.66 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  41.08 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  41.95 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  39.61 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  39.06 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  36.57 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  37.29 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  37.94 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  31.99 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  25.08 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  27.24 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.75 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.62 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  25.94 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.34 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  22.57 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  25.37 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.98 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  26.21 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  26.21 
 
 		 456 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  27.22 
 
 		 458 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  30.99 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  23.29 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>