61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1499 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  72.31 
 
 
456 aa  703    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  100 
 
 
456 aa  934    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  72.53 
 
 
456 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  58.42 
 
 
456 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  56.58 
 
 
458 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  57.24 
 
 
457 aa  533  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  52.47 
 
 
440 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  52.8 
 
 
445 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  51 
 
 
445 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.02 
 
 
428 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.02 
 
 
429 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.2 
 
 
435 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.2 
 
 
435 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.84 
 
 
433 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.33 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.47 
 
 
433 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.28 
 
 
428 aa  169  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.15 
 
 
433 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.41 
 
 
433 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  33.33 
 
 
370 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.32 
 
 
377 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.13 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.36 
 
 
356 aa  88.2  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  27.08 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.19 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.55 
 
 
313 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  23.65 
 
 
370 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  24.24 
 
 
340 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  43.55 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  49.02 
 
 
421 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  47.06 
 
 
417 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  23.47 
 
 
571 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  23.3 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  23.08 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  41.18 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  27.69 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.65 
 
 
77 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  39.39 
 
 
514 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  21.41 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  39.51 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  24.02 
 
 
305 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 
455 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.82 
 
 
1557 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1864  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  44 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.498098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  23.47 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.51 
 
 
1261 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 
116 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
266 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  33.87 
 
 
438 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.86 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  48.98 
 
 
458 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  28.16 
 
 
305 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46 
 
 
317 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  42.31 
 
 
391 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 
1012 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.41 
 
 
327 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  28.93 
 
 
337 aa  43.1  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>