67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0685 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  100 
 
 
440 aa  908    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  73.2 
 
 
445 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  55.56 
 
 
445 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  52.81 
 
 
456 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  52.81 
 
 
456 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  52.47 
 
 
456 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  53.42 
 
 
456 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  54.42 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  53.2 
 
 
458 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.69 
 
 
429 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.27 
 
 
433 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.23 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.66 
 
 
435 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.44 
 
 
435 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.43 
 
 
428 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.19 
 
 
435 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.63 
 
 
433 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.89 
 
 
433 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.05 
 
 
433 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.84 
 
 
377 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.16 
 
 
356 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.15 
 
 
378 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  29.28 
 
 
370 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  27.32 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  28.12 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  26.37 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  31.69 
 
 
370 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  29.17 
 
 
340 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  30.56 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  30.71 
 
 
337 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  28.67 
 
 
313 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  27.91 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  29.17 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  25.52 
 
 
302 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  25.29 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  29.93 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  22.08 
 
 
311 aa  47  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  25.54 
 
 
310 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  32.61 
 
 
267 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  24.48 
 
 
341 aa  46.6  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  43.86 
 
 
418 aa  46.6  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  24.73 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  32.63 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  24.15 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  25.29 
 
 
571 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  44.44 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 
116 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  42.59 
 
 
469 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0246  hypothetical protein  30.63 
 
 
388 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  39.29 
 
 
576 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  47.06 
 
 
267 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.71 
 
 
508 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  46.81 
 
 
740 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.57 
 
 
346 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 
464 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 
470 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3803  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.93 
 
 
328 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633002  normal  0.020318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  45.1 
 
 
270 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 
451 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  24.04 
 
 
303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  24.04 
 
 
303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  42.11 
 
 
407 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  24.04 
 
 
303 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 
480 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>