61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2333 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  100 
 
 
445 aa  916    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  55.53 
 
 
445 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  55.56 
 
 
440 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  51 
 
 
456 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  49.67 
 
 
456 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3807  OpcA protein  49.89 
 
 
456 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  51.66 
 
 
456 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  49.45 
 
 
457 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  48.56 
 
 
458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  33.25 
 
 
429 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  32.69 
 
 
435 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  32.36 
 
 
428 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.46 
 
 
428 aa  206  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.34 
 
 
433 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11631  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  31.12 
 
 
433 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11791  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.89 
 
 
433 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.648629  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1084  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.66 
 
 
433 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00820533  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.54 
 
 
435 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  28.54 
 
 
435 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.01 
 
 
378 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.87 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  24.75 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25.81 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1975  glucose 6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA, putative  30 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.82 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  30.77 
 
 
370 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  24.31 
 
 
311 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  31.54 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  27.83 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  31.54 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  27.03 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.42 
 
 
318 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  30.26 
 
 
406 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  27.68 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.11 
 
 
313 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  32.38 
 
 
341 aa  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  30.99 
 
 
571 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  30.26 
 
 
313 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  26.82 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  26.82 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  26.82 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  30.22 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  27.96 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  26.5 
 
 
305 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  29.14 
 
 
306 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  47.17 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  30.34 
 
 
308 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.74 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3399  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.59 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  36.62 
 
 
267 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 
312 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 
398 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25 
 
 
319 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 
398 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
412 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.38 
 
 
323 aa  43.9  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  39.19 
 
 
228 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  27.03 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  40.35 
 
 
398 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  25 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  43.4 
 
 
438 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>