80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6616 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6616  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 239 aa  474  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  53.97 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.84 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.36 
 
 		 433 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 422 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.92 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  51.79 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  47.69 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.64 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  45.21 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.63 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.62 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.37 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.62 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6617  hypothetical protein  32.99 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.85 
 
 		 412 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1274  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.37 
 
 		 370 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  38.67 
 
 		 383 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  52.73 
 
 		 445 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  44.12 
 
 		 762 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  49.12 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 508 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  50.94 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  48.21 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 575 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.88 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.06 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 160 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 974 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 554 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  41.07 
 
 		 423 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.61 
 
 		 629 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  41.38 
 
 		 406 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 		 482 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  65.71 
 
 		 334 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.76 
 
 		 330 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  46.43 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  46.43 
 
 		 395 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  45.28 
 
 		 381 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 307 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  48.21 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 321 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 395 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  36.84 
 
 		 383 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 395 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 398 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3010  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.98 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.79964  hitchhiker  0.00810572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.21 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.21 
 
 		 792 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.06 
 
 		 372 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 327 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.12 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4073  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.87 
 
 		 382 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1939  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.19325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  44.64 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  48.28 
 
 		 358 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3376  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135987 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 480 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.17 
 
 		 182 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 528 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  44.83 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.21 
 
 		 323 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.94 
 
 		 201 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  44.83 
 
 		 426 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 		 329 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  44.12 
 
 		 270 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.11 
 
 		 228 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.84 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.5 
 
 		 294 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>