237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0930 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
740 aa  1518    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.01 
 
 
536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.85 
 
 
395 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.83 
 
 
562 aa  176  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  35.53 
 
 
422 aa  174  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.79 
 
 
564 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  39.27 
 
 
385 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  35.53 
 
 
390 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.97 
 
 
580 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.79 
 
 
540 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  35.27 
 
 
291 aa  172  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.79 
 
 
577 aa  172  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.52 
 
 
562 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  35.64 
 
 
291 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.03 
 
 
562 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  33.23 
 
 
563 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  35.79 
 
 
392 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 
562 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.46 
 
 
558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.72 
 
 
589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  34.91 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.06 
 
 
568 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  36.73 
 
 
387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  36.7 
 
 
554 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.87 
 
 
536 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  31.9 
 
 
541 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  35.77 
 
 
549 aa  163  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.33 
 
 
557 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 
557 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 
557 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 
557 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.68 
 
 
587 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  35.55 
 
 
271 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.69 
 
 
562 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.14 
 
 
536 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  30.83 
 
 
563 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  32.84 
 
 
584 aa  160  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 
559 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.8 
 
 
427 aa  160  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.46 
 
 
538 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.83 
 
 
541 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  33.21 
 
 
388 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  34.75 
 
 
498 aa  157  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.66 
 
 
532 aa  157  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  36.89 
 
 
529 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  33.71 
 
 
831 aa  156  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.91 
 
 
372 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  36.95 
 
 
439 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
572 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  32.47 
 
 
388 aa  154  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.91 
 
 
372 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  30.65 
 
 
538 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.46 
 
 
557 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  32.97 
 
 
371 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.52 
 
 
613 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  34.08 
 
 
358 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  33.46 
 
 
341 aa  151  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  33.96 
 
 
357 aa  151  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  32.44 
 
 
532 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  34.69 
 
 
334 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  32.84 
 
 
303 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  31.47 
 
 
368 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  32.85 
 
 
284 aa  147  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  32.69 
 
 
300 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  31.83 
 
 
437 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.71 
 
 
395 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  34.17 
 
 
302 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  31.6 
 
 
346 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  29.52 
 
 
459 aa  142  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30.33 
 
 
563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  30.58 
 
 
422 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.15 
 
 
556 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  30.15 
 
 
353 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  31.15 
 
 
368 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  38.04 
 
 
302 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  29.91 
 
 
447 aa  138  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  30.31 
 
 
349 aa  138  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  33.07 
 
 
570 aa  137  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  36.94 
 
 
381 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.52 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  30.6 
 
 
338 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  29.74 
 
 
307 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.58 
 
 
281 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  32.58 
 
 
308 aa  133  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  29.72 
 
 
310 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  32.53 
 
 
300 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.21 
 
 
364 aa  130  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 
301 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  31.56 
 
 
310 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  36.97 
 
 
261 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  30.92 
 
 
309 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  31.56 
 
 
309 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  36.49 
 
 
261 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  30.9 
 
 
302 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  32.58 
 
 
314 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  31.58 
 
 
281 aa  125  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  30.65 
 
 
318 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  31.16 
 
 
302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  31.91 
 
 
291 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>