44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0878 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.53 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0578  peptidoglycan-binding protein, putative  34.64 
 
 		 338 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0578  putative peptidoglycan-binding protein  34.64 
 
 		 338 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0885  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.31 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0426  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.43216  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  37.29 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2249  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 116 aa  51.6  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.67 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.73 
 
 		 1261 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 386 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.22 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 1226 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.61 
 
 		 487 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 450 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  48.94 
 
 		 395 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  44.68 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  47.92 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 1557 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  29.75 
 
 		 395 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  46.15 
 
 		 424 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  44.23 
 
 		 425 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 434 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  42.86 
 
 		 456 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  35.09 
 
 		 454 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  43.1 
 
 		 408 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.94 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 395 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  32.31 
 
 		 442 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1402  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.89 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742289  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  39.02 
 
 		 438 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  43.9 
 
 		 438 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3336  hypothetical protein  33.62 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.986387  normal  0.0446379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 438 aa  42.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  40.38 
 
 		 448 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.68 
 
 		 478 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.77 
 
 		 457 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 508 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>