24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6252 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 386 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.06 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.3 
 
 		 864 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.85 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0878  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 266 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605473  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0033  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 346 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.259592  normal  0.110455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  25 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 1226 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  38.46 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1275 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 508 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.25 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.9 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.81 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  22.86 
 
 		 762 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2467  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 523 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000299001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.74 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1795  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 		 136 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1874  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 		 136 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  46.51 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2082  peptidoglycan-binding protein  34.44 
 
 		 135 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>