More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0601 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.05 
 
 		 1263 aa  880    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 1275 aa  2523    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.58 
 
 		 1226 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.91 
 
 		 1260 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 1196 aa  436  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  33.16 
 
 		 978 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 1261 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  31.07 
 
 		 913 aa  318  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.22 
 
 		 1012 aa  228  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.22 
 
 		 1110 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1059 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  30.48 
 
 		 1081 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  49.46 
 
 		 1134 aa  191  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  43.64 
 
 		 1086 aa  190  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  47.83 
 
 		 1105 aa  188  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  47.42 
 
 		 1105 aa  185  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  53.54 
 
 		 1242 aa  181  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 1072 aa  173  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.66 
 
 		 1110 aa  172  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  48.66 
 
 		 1145 aa  171  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.55 
 
 		 1088 aa  170  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.03 
 
 		 1199 aa  157  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  48.13 
 
 		 1003 aa  157  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  43.33 
 
 		 795 aa  151  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.12 
 
 		 884 aa  136  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 997 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  40.67 
 
 		 684 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  44.3 
 
 		 961 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 831 aa  118  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  43.62 
 
 		 373 aa  117  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.42 
 
 		 373 aa  117  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  40.94 
 
 		 305 aa  115  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.99 
 
 		 490 aa  112  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  40.24 
 
 		 490 aa  112  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.26 
 
 		 789 aa  111  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.75 
 
 		 241 aa  111  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39 
 
 		 489 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1402 aa  110  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  41.03 
 
 		 276 aa  108  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  40.13 
 
 		 393 aa  108  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 318 aa  108  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1037 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.6 
 
 		 235 aa  107  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.61 
 
 		 416 aa  105  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.65 
 
 		 232 aa  103  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.95 
 
 		 267 aa  102  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.42 
 
 		 329 aa  102  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  41.04 
 
 		 1032 aa  101  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1493 aa  100  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.31 
 
 		 264 aa  101  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.95 
 
 		 376 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 		 303 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.24 
 
 		 2413 aa  100  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.95 
 
 		 376 aa  99.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 255 aa  99.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.76 
 
 		 185 aa  99  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.28 
 
 		 838 aa  99  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  42.28 
 
 		 255 aa  99  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.42 
 
 		 208 aa  98.6  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1877 aa  98.2  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  37.13 
 
 		 464 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  34.05 
 
 		 274 aa  98.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  32.52 
 
 		 344 aa  98.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.38 
 
 		 392 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 448 aa  97.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  33.53 
 
 		 410 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  39.58 
 
 		 380 aa  96.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  34.16 
 
 		 193 aa  95.5  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.33 
 
 		 890 aa  95.5  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.93 
 
 		 321 aa  95.1  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.07 
 
 		 245 aa  95.1  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 380 aa  94.7  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.99 
 
 		 331 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  30.99 
 
 		 331 aa  94  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 528 aa  94  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.13 
 
 		 348 aa  93.6  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.37 
 
 		 246 aa  94  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.99 
 
 		 331 aa  94  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.67 
 
 		 343 aa  93.2  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 		 557 aa  93.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.59 
 
 		 316 aa  93.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 252 aa  92.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  32.47 
 
 		 552 aa  92.8  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.03 
 
 		 425 aa  92  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.57 
 
 		 256 aa  91.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.52 
 
 		 685 aa  90.9  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  33.19 
 
 		 315 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 278 aa  90.5  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.49 
 
 		 254 aa  89.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  41.35 
 
 		 221 aa  89.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  34.23 
 
 		 303 aa  89.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 		 346 aa  89.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  35.77 
 
 		 680 aa  88.6  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.97 
 
 		 358 aa  89  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 341 aa  88.6  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1002 aa  88.6  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  37.13 
 
 		 365 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.91 
 
 		 731 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.99 
 
 		 325 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  35.15 
 
 		 1910 aa  87  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>