101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2916 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 864 aa  1748    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0911  hypothetical protein  33.38 
 
 		 696 aa  334  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.331419  normal  0.0172395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4187  hypothetical protein  30.17 
 
 		 735 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0921562  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  55.36 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  55.36 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  46.88 
 
 		 228 aa  60.1  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  53.45 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  40.7 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.62 
 
 		 270 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 77 aa  56.6  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  51.79 
 
 		 438 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 391 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.25 
 
 		 294 aa  55.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 1089 aa  54.3  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 294 aa  54.3  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 487 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 319 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 422 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  52 
 
 		 404 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 232 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6252  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 386 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  45.28 
 
 		 335 aa  52  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  39.68 
 
 		 243 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  51.2  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  48.21 
 
 		 379 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.5 
 
 		 762 aa  51.2  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 		 433 aa  50.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  45.16 
 
 		 292 aa  50.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 635 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2188  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.89 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  46.67 
 
 		 349 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  42.19 
 
 		 228 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 508 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  45.83 
 
 		 978 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 322 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  45.83 
 
 		 913 aa  49.7  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 395 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 454 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  46.03 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.44 
 
 		 280 aa  48.9  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 		 168 aa  48.9  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 143 aa  48.5  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.54 
 
 		 239 aa  48.5  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.32 
 
 		 324 aa  48.9  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 327 aa  48.5  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 245 aa  48.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.94 
 
 		 1196 aa  48.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 398 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.33 
 
 		 326 aa  47.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  44.44 
 
 		 256 aa  48.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 		 476 aa  47.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  48.08 
 
 		 398 aa  47.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.1 
 
 		 1557 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 		 344 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  43.55 
 
 		 224 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1312  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 307 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.08 
 
 		 160 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  43.33 
 
 		 2277 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  48.98 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.07 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  34.52 
 
 		 486 aa  46.6  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  41.07 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.3 
 
 		 233 aa  47  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.33 
 
 		 225 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 254 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 562 aa  46.2  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4194  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 528 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 1012 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0750  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.47 
 
 		 531 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  34.33 
 
 		 480 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 305 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  42.62 
 
 		 234 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  51.11 
 
 		 389 aa  45.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46 
 
 		 398 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3052  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.71 
 
 		 541 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46 
 
 		 398 aa  45.8  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 		 383 aa  45.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.38 
 
 		 233 aa  45.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0157  lytic murein transglycosylase  45.24 
 
 		 418 aa  45.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36 
 
 		 283 aa  45.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2196  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 		 399 aa  45.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  42.37 
 
 		 247 aa  45.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46 
 
 		 398 aa  45.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.33 
 
 		 274 aa  45.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.43 
 
 		 382 aa  45.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 1261 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 300 aa  44.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2786  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 587 aa  44.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2284  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 198 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  50 
 
 		 434 aa  44.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.67 
 
 		 243 aa  44.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  35 
 
 		 321 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  48.72 
 
 		 442 aa  44.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 285 aa  44.3  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 792 aa  44.3  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>