71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09470  putative peptidoglycan binding protein  100 
 
 		 335 aa  653    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.265495  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0082  hypothetical protein  35.12 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.619134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1583  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.31 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.474827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0853  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.99 
 
 		 360 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3175  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.19 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1588  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.22 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0248929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21610  hypothetical protein  36.42 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5941  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.46 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0306  hypothetical protein  39.81 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0084  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.97 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1030  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.57 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4786  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.45 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0569189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3473  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.32 
 
 		 580 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0027  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.41 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0582  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.41 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25300  membrane-fusion protein  29.27 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0225  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.03 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0478  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.97 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4070  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00672322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2962  hypothetical protein  36.19 
 
 		 547 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.41173  hitchhiker  0.00173595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0373  hypothetical protein  36.05 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.417823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33580  putative peptidoglycan binding protein  32.71 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8552  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.24 
 
 		 587 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.51 
 
 		 239 aa  52.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4331  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.79 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 		 864 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8187  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 593 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  42 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  31.9 
 
 		 406 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  49.06 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0814  hypothetical protein  31.62 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0429314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4328  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.96 
 
 		 568 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238879  normal  0.546066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  40.32 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  41.51 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 667 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  35.96 
 
 		 2277 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.19 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.57 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  36.05 
 
 		 395 aa  46.2  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 77 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  29.59 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  38.46 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27870  hypothetical protein  34.62 
 
 		 515 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  39.29 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  44 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  40.38 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  34.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3158  hypothetical protein  40.91 
 
 		 542 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 554 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.21 
 
 		 762 aa  43.1  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  31.48 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 382 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  37.74 
 
 		 234 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  33.8 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 319 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  33.96 
 
 		 234 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46 
 
 		 225 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  37.5 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>