More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0025 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
1261 aa  2517    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 
1196 aa  539  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  36.9 
 
 
978 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  34.24 
 
 
913 aa  432  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.55 
 
 
1226 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.27 
 
 
1263 aa  341  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.84 
 
 
1260 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  47.38 
 
 
1275 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.98 
 
 
1012 aa  215  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  45.53 
 
 
1086 aa  199  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.97 
 
 
1110 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  51.56 
 
 
1105 aa  190  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  39.39 
 
 
1160 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  51.89 
 
 
1134 aa  189  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  50.51 
 
 
1242 aa  186  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5759  Sel1 domain-containing protein  45.93 
 
 
1081 aa  183  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.28 
 
 
1072 aa  177  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50 
 
 
1199 aa  172  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  48.39 
 
 
1003 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  43.81 
 
 
795 aa  154  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.96 
 
 
884 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.21 
 
 
997 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  44.38 
 
 
416 aa  129  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  42.31 
 
 
831 aa  124  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.77 
 
 
684 aa  123  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  42.76 
 
 
1032 aa  122  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  45.1 
 
 
961 aa  121  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
303 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.69 
 
 
489 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.11 
 
 
1402 aa  118  6e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.95 
 
 
246 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.87 
 
 
376 aa  117  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.52 
 
 
241 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.26 
 
 
318 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  39.22 
 
 
376 aa  116  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.3 
 
 
393 aa  116  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.38 
 
 
789 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.85 
 
 
1877 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.49 
 
 
293 aa  114  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  38.66 
 
 
557 aa  114  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  39.07 
 
 
305 aa  112  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.44 
 
 
373 aa  111  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 
380 aa  111  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.44 
 
 
256 aa  110  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.58 
 
 
232 aa  110  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.44 
 
 
373 aa  109  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  40.38 
 
 
685 aa  108  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.69 
 
 
425 aa  108  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  39.86 
 
 
185 aa  108  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.95 
 
 
255 aa  108  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.55 
 
 
490 aa  108  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35 
 
 
490 aa  107  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.52 
 
 
448 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  37.42 
 
 
1037 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.16 
 
 
2413 aa  107  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.89 
 
 
316 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.91 
 
 
264 aa  107  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.82 
 
 
271 aa  106  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.88 
 
 
392 aa  106  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.64 
 
 
321 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.54 
 
 
1493 aa  105  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  41.28 
 
 
1910 aa  105  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.91 
 
 
343 aa  105  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 
341 aa  104  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.51 
 
 
329 aa  104  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  30.24 
 
 
344 aa  104  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.49 
 
 
528 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  38.46 
 
 
235 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 
346 aa  103  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  34.76 
 
 
254 aa  103  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  37.67 
 
 
202 aa  103  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.95 
 
 
278 aa  101  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.71 
 
 
552 aa  101  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.13 
 
 
1002 aa  101  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  40.38 
 
 
464 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.26 
 
 
267 aa  99  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.62 
 
 
208 aa  99  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.3 
 
 
193 aa  98.2  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 
380 aa  98.2  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.13 
 
 
274 aa  98.2  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.82 
 
 
315 aa  98.2  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
252 aa  98.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
976 aa  97.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.14 
 
 
348 aa  97.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.94 
 
 
255 aa  96.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.46 
 
 
223 aa  96.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.18 
 
 
359 aa  96.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.46 
 
 
482 aa  96.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  39.04 
 
 
358 aa  95.5  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  95.5  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.73 
 
 
325 aa  94.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 
410 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  32.79 
 
 
218 aa  94  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 
325 aa  94.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  33.77 
 
 
331 aa  94  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.22 
 
 
342 aa  94  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.25 
 
 
365 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
223 aa  93.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.58 
 
 
680 aa  92.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
1430 aa  92.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>