83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3834 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  88.84 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  87.93 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  77.59 
 
 		 232 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  69.85 
 
 		 199 aa  278  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3332  hypothetical protein  63.36 
 
 		 163 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  73.56 
 
 		 98 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4883  hypothetical protein  53.91 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.97 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.36 
 
 		 954 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  35.4 
 
 		 159 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  35.51 
 
 		 153 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  31.46 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  32.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  33.57 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  34.53 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  33.57 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  34.53 
 
 		 153 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  37.3 
 
 		 136 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  35.43 
 
 		 136 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  35.43 
 
 		 136 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  35.56 
 
 		 179 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4245  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.06 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  42.42 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  33.9 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  37.37 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  33.13 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  36.46 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  35.42 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3543  hypothetical protein  52.73 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  33.65 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  27.66 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  36.56 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  51.72 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.07 
 
 		 143 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.92 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  47.69 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  50.91 
 
 		 417 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.36 
 
 		 260 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  30.88 
 
 		 147 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  47.27 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  32.95 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.03 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  35.51 
 
 		 358 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  33.07 
 
 		 383 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 77 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  50.98 
 
 		 349 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  29.63 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  47.37 
 
 		 423 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.38 
 
 		 864 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.62 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  50.91 
 
 		 421 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.44 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  49.02 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1084 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  50.91 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.06 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 422 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  50.91 
 
 		 419 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  49.12 
 
 		 378 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.37 
 
 		 382 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.86 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  44.64 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  63.89 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 300 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  30.23 
 
 		 921 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  36.25 
 
 		 392 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.62 
 
 		 792 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  38.6 
 
 		 2277 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 163 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  52.5 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.6 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  41.67 
 
 		 352 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  43.86 
 
 		 438 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.12 
 
 		 433 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 		 182 aa  42  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 326 aa  41.6  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>