20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0791 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  517  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  30.2 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.18 
 
 		 954 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  24.83 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  24.83 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.95 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.95 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  33.66 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  24.32 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  25.96 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  26.83 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  32.53 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  23.85 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.47 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  24.43 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  25.95 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  25.95 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>