37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0776 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  38.75 
 
 		 153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  37.42 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  44.68 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  44.68 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  41.72 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  41.38 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  40.14 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  40.14 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  43.42 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  40.71 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  38.57 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.24 
 
 		 954 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  44.86 
 
 		 247 aa  84.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  34.71 
 
 		 921 aa  71.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  32.39 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.21 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  32.62 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  33.94 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.37 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1084 aa  58.5  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  39.18 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  32.32 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  35.48 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  37.23 
 
 		 264 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.45 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  34.34 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  28.85 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  28.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  31.87 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  31.68 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  38.36 
 
 		 309 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1833  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0439402  hitchhiker  0.00000000491312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>