39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2666 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4245  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  75.89 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.5 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.08 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.5 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.97 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  37 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  37 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  31.6 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  38.61 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  36 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  37.25 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  37.25 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  37.62 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  35.92 
 
 		 136 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  34.65 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  38 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  30.12 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  38.64 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.41 
 
 		 954 aa  65.1  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  40.23 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  36.11 
 
 		 921 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  34.31 
 
 		 260 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  33.98 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  32 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  28.24 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2562  hypothetical protein  24.16 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2250  hypothetical protein  24.06 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  31 
 
 		 264 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.32 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  28.95 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  26.47 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  34.12 
 
 		 1017 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.67 
 
 		 864 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1084 aa  42.4  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>