16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1935 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  100 
 
 		 147 aa  296  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2562  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2250  hypothetical protein  41.61 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  41.41 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  36.52 
 
 		 921 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.08 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 233 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4245  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.1 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.88 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  34.04 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  31.63 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  35.16 
 
 		 227 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  32.63 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  28.43 
 
 		 159 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>