33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1370 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 921 aa  1870    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4720  hypothetical protein  24 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0821  hypothetical protein  29.68 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  33.53 
 
 		 186 aa  67.4  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  34.85 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  34.62 
 
 		 148 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  31.33 
 
 		 153 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.61 
 
 		 954 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  35.1 
 
 		 179 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  36.52 
 
 		 147 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  32.28 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  32.28 
 
 		 136 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  31.78 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2562  hypothetical protein  36.04 
 
 		 140 aa  57.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.11 
 
 		 224 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  56.2  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3567  hypothetical protein  27.4 
 
 		 331 aa  54.7  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266134 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  33.57 
 
 		 208 aa  54.7  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  33.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2846  hypothetical protein  23.85 
 
 		 425 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.542559  normal  0.824036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  31.5 
 
 		 136 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  33.08 
 
 		 208 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.54 
 
 		 232 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.21 
 
 		 232 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2185  hypothetical protein  48.78 
 
 		 511 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3679  hypothetical protein  31.4 
 
 		 414 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.480186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  31.01 
 
 		 199 aa  45.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2916  hypothetical protein  27.63 
 
 		 347 aa  45.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1721  hypothetical protein  27.78 
 
 		 456 aa  44.3  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>