35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0935 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  42.5 
 
 		 136 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  40.83 
 
 		 153 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  40.83 
 
 		 153 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  40.83 
 
 		 136 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  42.5 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  42.02 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  40.34 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  42.02 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  41.18 
 
 		 148 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  40.83 
 
 		 136 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  41.18 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  41.18 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.52 
 
 		 954 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.29 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  39.09 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.9 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.64 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.75 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  34.85 
 
 		 921 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  31.36 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  52  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 147 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  33.02 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1084 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 347 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  32.53 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  29.49 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2562  hypothetical protein  32.38 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  34.15 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  32.98 
 
 		 247 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 349 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>