31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4250 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  65.29 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  54.64 
 
 		 247 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  69.68 
 
 		 227 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  80.67 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  80.83 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  74.34 
 
 		 217 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  58.82 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.41 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  36.84 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.22 
 
 		 954 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.37 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  34.02 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  34.02 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  35.79 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  32.99 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  32.99 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  34.74 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  31.96 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  31.96 
 
 		 136 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  31.96 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  32.99 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  31.18 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  38.71 
 
 		 562 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  29.17 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.24 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  28.34 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  34.15 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>