34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0353 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  89.45 
 
 		 232 aa  357  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  76.38 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  72.36 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  69.85 
 
 		 233 aa  278  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3332  hypothetical protein  75.57 
 
 		 163 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4883  hypothetical protein  63.36 
 
 		 146 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  79.35 
 
 		 98 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.77 
 
 		 954 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  34.29 
 
 		 153 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  36.23 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  35.77 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  35.77 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  32.84 
 
 		 136 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  34.33 
 
 		 136 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  29.93 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.6 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  34.07 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3543  hypothetical protein  59.26 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  31.21 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  31.36 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  32.98 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  30.59 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  29.47 
 
 		 290 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  28.12 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  29.9 
 
 		 247 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  31.01 
 
 		 921 aa  45.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  39.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>