39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2232 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  330  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.03 
 
 		 232 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.42 
 
 		 232 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.36 
 
 		 233 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.85 
 
 		 954 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  39.16 
 
 		 199 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.27 
 
 		 233 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  41.3 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  39.72 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  39.72 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  38.41 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  39.26 
 
 		 136 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  39.85 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  38.41 
 
 		 208 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  36.69 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  37.41 
 
 		 206 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.13 
 
 		 224 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  33.1 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  39.78 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  36.56 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  36.56 
 
 		 247 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  28.95 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  33.66 
 
 		 251 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  45.98 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4883  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  31.58 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  41.76 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  40.66 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  40.32 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1084 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  36.89 
 
 		 260 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  38.04 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  25.56 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3310  hypothetical protein  31.48 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1754  CHAP domain-containing protein  30.48 
 
 		 228 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>