20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0448 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  87.36 
 
 		 232 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  79.35 
 
 		 199 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.56 
 
 		 233 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  72.41 
 
 		 233 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  71.26 
 
 		 232 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4883  hypothetical protein  58.23 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3543  hypothetical protein  66.67 
 
 		 61 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.23 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  38.37 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  35.82 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  32.81 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>