104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1579 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 232 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  84.05 
 
 		 232 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  80.6 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  89.45 
 
 		 199 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  77.59 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3332  hypothetical protein  80.15 
 
 		 163 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4883  hypothetical protein  66.41 
 
 		 146 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0939643  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  87.36 
 
 		 98 aa  156  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.08 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  38.41 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.48 
 
 		 954 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  37.14 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  37.23 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  37.23 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  35.51 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  35.51 
 
 		 153 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  36.23 
 
 		 153 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  34.78 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  36.09 
 
 		 136 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  35.07 
 
 		 136 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  36.57 
 
 		 136 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  36.3 
 
 		 179 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  30.66 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4245  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.33 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3543  hypothetical protein  64.81 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  34.75 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  31.21 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  29.76 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  55.93 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  37.23 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.56 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  51.72 
 
 		 378 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  32.69 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  48.28 
 
 		 438 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  31.54 
 
 		 921 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.77 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  32.99 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 		 382 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  48.28 
 
 		 409 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0031  putative cell wall degradation enzyme  40.79 
 
 		 739 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0604  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.57 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  30.21 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  30.2 
 
 		 358 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.14 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  43.1 
 
 		 387 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  46.58 
 
 		 352 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 		 792 aa  49.3  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  40.79 
 
 		 1017 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.92 
 
 		 77 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  51.92 
 
 		 349 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  44.83 
 
 		 379 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  48.28 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  43.1 
 
 		 392 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.17 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_46  putative cell wall degradation protein  38.16 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169743  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.08 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37540  PG-binding-1 domain-containing protein  60 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.91 
 
 		 163 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  47.27 
 
 		 417 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.79 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  41.67 
 
 		 381 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  46.55 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.66 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  45.9 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  39.66 
 
 		 2277 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0285  hypothetical protein  45.45 
 
 		 292 aa  45.4  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.88 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  43.75 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  49.15 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  45.61 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  47.27 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.21 
 
 		 447 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  66.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.28 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 		 433 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.51 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.64 
 
 		 864 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  43.1 
 
 		 383 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  48.21 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.21 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  46.43 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.27 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  43.64 
 
 		 437 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5126  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.45 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.94 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  44.44 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 396 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.11 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 360 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  56.82 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 575 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  45.45 
 
 		 401 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 256 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>