37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2349 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  91.85 
 
 
136 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  90.37 
 
 
153 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  90.37 
 
 
153 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  91.91 
 
 
136 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  91.91 
 
 
153 aa  259  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  80 
 
 
179 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  71.43 
 
 
208 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  71.43 
 
 
208 aa  205  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  68.42 
 
 
148 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  70.68 
 
 
208 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  68.42 
 
 
206 aa  197  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  39.57 
 
 
186 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.64 
 
 
232 aa  100  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.84 
 
 
233 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.09 
 
 
232 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.84 
 
 
954 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.43 
 
 
233 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  40.83 
 
 
247 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  35.61 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  34.91 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  31.03 
 
 
1084 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  32.99 
 
 
227 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  36.17 
 
 
208 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  31.5 
 
 
921 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  32.63 
 
 
290 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  31.58 
 
 
264 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  31.91 
 
 
200 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  32.29 
 
 
217 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  30.53 
 
 
247 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  41.38 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6578  hypothetical protein  31.58 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  22.15 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>