21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2148 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  41.26 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  53.33 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  51.72 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  48.94 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  39.04 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  50 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  61.54 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  50 
 
 		 954 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.26 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 		 233 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  41.38 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  41.38 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  41.38 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.16 
 
 		 232 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  39.68 
 
 		 199 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>