34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1193 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  57.85 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  78.45 
 
 		 247 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  47.74 
 
 		 264 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  74.34 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  55.81 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  72.31 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  41.05 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  60.94 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.05 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.86 
 
 		 954 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.95 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  36.84 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  35.79 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  41.76 
 
 		 159 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  35.42 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  35.79 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  36.46 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  35.42 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.38 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  30.21 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  36 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5049  CHAP domain containing protein  36.56 
 
 		 562 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  35.8 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  32.97 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3072  CHAP domain containing protein  27.19 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>