28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0789 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.62 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1935  putative signal peptide protein  41.41 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.13 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.07 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.76 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2250  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 921 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2562  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.3 
 
 		 954 aa  54.3  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  30.59 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  26.45 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  26.45 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  27.39 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  24.03 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  28.95 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  25.5 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  27.92 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  29.17 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  25.66 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  24.83 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  24.83 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  24.52 
 
 		 208 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  22.15 
 
 		 136 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>