27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2357 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  35.83 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  39.09 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.96 
 
 		 954 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  35.85 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  35.85 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  35.85 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  34.91 
 
 		 136 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  35.71 
 
 		 921 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  35.78 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  33.96 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  33.96 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.58 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.65 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  32.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.69 
 
 		 232 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.31 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3072  CHAP domain containing protein  30.56 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  29.17 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1084 aa  42.7  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  32.67 
 
 		 159 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>